日前，省財政廳聯合省審計廳出臺《“百千萬工程”專項資金使用管理監督辦法》（下稱《辦法》），對專項資金分配、使用和管理進行全面規范。其中，設立“百千萬工程”資金監管專戶，實施專戶管理、專戶調撥、專戶清算的“三?！惫芾砟Ｊ?，確保?？顚Ｓ?、資金安全。
根據《辦法》，“百千萬工程”專項資金實行專戶管理，資金和預算指標由省級直接分配細化至縣（市、區），庫款由省財政單獨調撥。省級安排到市縣且沒有明確到具體項目的“百千萬工程”專項資金，具體資金分配方案需報同級指揮部辦公室審核后再辦理資金撥付。
為積極推進實施“補改投”財政資金補助方式，《辦法》鼓勵各地研究創新“百千萬工程”資金使用方式，建立多元投入機制，充分發揮財政資金的撬動作用，積極引導金融和社會資本投入，更好保障“百千萬工程”重點任務實施。
在資金使用方面，《辦法》明確了“百千萬工程”專項資金使用范圍和負面清單，加力保障“百千萬工程”重點支出；嚴格“百千萬工程”專項資金使用范圍，明確專項資金僅用于包括支持發展壯大縣域經濟、提升縣城承載能力、強化鄉鎮聯城帶村功能、推進鄉村產業振興、加強縣域基礎設施建設等重點任務；同時，建立資金使用負面清單，明確“百千萬工程”專項資金不得用于行政事業單位基本支出、各種獎金津貼和福利補助、彌補企業虧損、違規修建樓堂館所、彌補預算支出缺口和償還債務等八大類與“百千萬工程”無關的支出。
此外，在資金管理方面，廣東將推動審計監督、財會監督貫通協同，加強監督檢查成果共享，健全重要情況定期通報等機制，形成合力監督態勢；依托“數字財政”“‘百千萬工程’信息綜合平臺”等信息化系統，加強對資金分配、使用、管理的實時穿透式跟蹤、全鏈條監控；并通過大數據分析預警擠占、挪用、截留等苗頭性、傾向性問題，依規依法開展實地復核；還將通過政府網站、粵省事平臺等渠道，及時公開“百千萬工程”重點任務保障資金安排和使用情況，主動接受社會各界監督。
